哪些企業將被征收環保稅？這是企業界最為關心的問題。
　　《環境保護稅(征求意見稿)》(以下簡稱《征求意見稿》)規定，在中國領域以及管轄的其他海域，直接向環境排放應稅污染物(包括大氣污染物、水污染物、固體廢物、建筑施工噪聲和工業噪聲以及其他污染物)的企業事業單位和其他生產經營者為環保稅的納稅人。
　　但是，企業事業單位和其他生產經營者向依法設立的城鎮污水處理廠、城鎮生活垃圾處理場排放應稅污染物的，以及企業事業單位和其他生產經營者在符合環境保護標準的設施、場所貯存或者處置的工業固體廢物，都不征收環保稅。
　　火電等14個行業為重點監控納稅對象
　　《征求意見稿》提出，環保稅按照重點監控(排污)納稅人和非重點監控(排污)納稅人進行分類管理。
　　所謂重點監控(排污)納稅人，指火電、鋼鐵、水泥、電解鋁、煤炭、冶金、建材、采礦、化工、石化、制藥、輕工(釀造、造紙、發酵、制糖、植物油加工)、紡織、制革等14個重點污染行業的納稅人及其他排污行業的重點監控企業。
　　全國工商聯環境商會秘書長駱建華對21世紀經濟報道分析，這14個重點污染行業就是最典型的“排放大戶”，主要是大氣和水污染物排放比較集中的高排放行業。
　　中電聯秘書長王志軒對21世紀經濟報道分析，環保稅對火電行業影響不大，一方面征收標準與過去基本一致，另一方面火電行業排放的大氣污染物絕對量已經相對很小了。
　　此外，《征求意見稿》規定，國務院和省、自治區、直轄市人民政府可以根據環境保護的需要增加(調整)重點污染行業種類。
　　四類征稅對象
　　《征求意見稿》提出，環保稅的征稅對象分為大氣污染物、水污染物、固體廢物和噪聲等4類，具體稅目按照稅目稅額表的規定執行。
　　對大氣污染物、水污染物的征收范圍，按每一排放口的污染物種類數以污染當量數從大到小的順序，最多不超過3項(重金屬污染物為5項)。省級人民政府可以根據本地區污染物減排的特殊需要，增加同一排放口征收環保稅的應稅污染物種類數。
　　在稅目稅額表中，水污染物包括第一、二類污染物共計61項污染物，其分類依據為《污水綜合排放標準》(GB8978-1996)。《征求意見稿》要求，同一排放口中的化學需氧量(COD)、生化需氧量(BOD5)和總有機碳(TOC)，只征收一項。
　　兩種情況可加倍征收環保稅
　　《征求意見稿》規定的稅額標準與現行排污費的征收標準基本一致。省級人民政府可以統籌考慮本地區環境承載能力、污染排放現狀和經濟社會生態發展目標要求，在規定的稅額標準上適當上浮應稅污染物的適用稅額，并報國務院備案。對超標、超總量排放污染物的，加倍征收環保稅。對依照環境保護稅法規定征收環保稅的，不再征收排污費。
　　《征求意見稿》規定，企業在超標排放的兩種情況下，會被加倍征收環保稅。
　　具體來說，當污染物排放濃度值高于國家或者地方規定的污染物排放標準的，或者污染物排放量高于規定的排放總量指標的，按照當地適用稅額標準的2倍計征。
　　另外一種情況是，污染物排放濃度值高于國家或者地方規定的污染物排放標準，同時污染物排放量高于規定的排放總量指標的，按照當地適用稅額標準的3倍計征。
　　同時，《征求意見稿》也規定了環保稅“打折”的情況。納稅人排放應稅大氣污染物和水污染物的濃度值低于國家或者地方規定污染物排放標準50%以上，且未超過污染物排放總量控制指標的，省、自治區、直轄市人民政府可以決定在一定期限內減半征收環保稅。
　　免征環保稅的優惠情景
　　同時，《征求意見稿》提出，國務院根據社會公共利益的特殊需要或者應對重大突發事件，可以制定環境保護稅專項優惠政策，報全國人民代表大會常務委員會備案。
　　納稅人免征環保稅的優惠情景，包括農業生產(不包括規模化養殖)排放的應稅污染物；機動車、鐵路機車、非道路移動機械、船舶和航空器等流動污染源排放的應稅污染物；城鎮污水處理廠、城鎮生活垃圾處理場向環境排放污染物，不超過國家規定排放標準的。
　　其中，對機動車等交通工具排放應稅污染物免征環保稅，環保部環境規劃院環境經濟部主任葛察忠對21世紀經濟報道分析，“其中既有交通工具污染物排放量難以核定的原因，也有交通工具已有車船稅和燃油稅等稅收項目的原因。”
　　企業如何繳納環保稅
　　《征求意見稿》規定，納稅人應當向應稅污染物排放地的主管稅務機關申報繳納環保稅。
　　環保稅按月、按季或者按年計征，由主管稅務機關根據實際情況確定。不能按固定期限計算納稅的，可以按次申報納稅。
　　根據《征求意見稿》，納稅人應當自納稅期限屆滿之日起15日內，向主管稅務機關辦理納稅申報并繳納稅款。
　　就申報內容而言，重點監控(排污)企業與非重點監控(排污)企業差別較大。其中，重點監控(排污)納稅人排放應稅污染物的種類、數量等申報情況，由主管稅務機關自納稅期限屆滿之日起5日內提請環境保護主管部門審核，環境保護主管部門自收到申報資料之日起30日內向主管稅務機關出具審核意見。
　　非重點監控(排污)納稅人的申報資料，由主管稅務機關會同環境保護主管部門聯合核定并公告。具體辦法由省、自治區、直轄市人民政府規定。
　　同時，如果納稅企業從事海洋工程向中國管轄海域排放應稅大氣污染物、水污染物和固體廢物的，比照本法相關規定申報繳納環境保護稅。具體納稅申報事項由國務院稅務主管部門會同海洋主管部門規定。
　　此外，如果納稅企業未按規定向稅務機關申報納稅，將依照《稅收征收管理法》《環境保護法》和相關法律法規的規定遭受相應處罰。